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論文

Effect of conformational states on protein dynamical transition

中川 洋; 上久保 裕生*; 片岡 幹雄

Biochimica et Biophysica Acta; Proteins and Proteomics, 1804(1), p.27 - 33, 2010/01

 被引用回数:19 パーセンタイル:46.88(Biochemistry & Molecular Biology)

折れ畳まったタンパク質の特性を調べるため、野生型と欠損変異体のスタフィロコッカルヌクレアーゼを用いて非干渉性中性子弾性散乱によりタンパク質の動力学転移に対する構造状態の効果を調べた。変異体はC末端の13残基を欠損させたもので、コンパクトな変性構造を取り、天然変性タンパク質のモデルとされている。非干渉性中性子弾性散乱実験はILLのIN10とIN13で行われた。弾性散乱強度のQ依存性をさまざまな温度で測定し、平均二乗変位を求めた。乾燥タンパク質と水和タンパク質で測定を行った。水和タンパク質では野生型と変異体では差がなかったが、乾燥状態では差が見られた。140Kの転移は乾燥状態と水和状態の両方で見られるが、転移温度前後での平均二乗変位の温度依存性は両者で異なり、折り畳みによる構造のハードニングが見られた。水和によってさらに240Kの転移が生じるが、構造状態には依存しない。これにより水和水のダイナミクスがタンパク質動力学を支配していると言える。

口頭

Structure and dynamics of the protein hydration water at the protein dynamical transition

中川 洋; 城地 保昌*; 北尾 彰朗*; 片岡 幹雄

no journal, , 

The dynamical transition of a protein has been observed at 200 - 240 K with the hydrated protein. We studied hydration level dependence of the hydration water structure and dynamics at the dynamical transition of a protein Staphylococcal nuclease by inelastic neutron scattering and molecular dynamics simulation. It was found that hydration dependent protein dynamical transition was observed around 240K, which was more significant above the threshold hydration level between 0.30 and 0.42 (g water/g protein). Above the threshold hydration level, the connectivities of the hydration water via hydrogen bond spread over the protein surface. Furthermore the hydrogen bond network among the hydration water encircles the whole protein, and the hydration water is percolated on the protein surface. Therefore, the protein dynamical transition is highly correlated with the percolation transition of the hydration water. At the percolation transition the translational dynamics of the hydration water markedly increase. The dynamical behavior of hydration water is coupled with the protein dynamics via hydrogen-bond network at protein-water interface. Such a dynamical coupling drives the hydration dependent protein dynamical transition.

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